El clima de Niš es continental, con inviernos fríos y veranos calurosos.
La ciudad está ubicada en el sureste de Serbia, a una altitud de 200 metros. En invierno, el suelo está cubierto de nieve durante 40 días al año. Debido a su posición, en la parte centro-sur de la península de los Balcanes, en invierno está expuesta a las olas de frío del norte, mientras que en verano está sujeta a olas de calor, donde la temperatura puede alcanzar los 40 °C. Por ejemplo, en 1987 la temperatura bajó a -20,3 °C en enero y alcanzó 42,3 °C en julio, mientras que en 2012 pasó de -18 °C en enero a 41 °C en julio. El récord de frío, -28,9 °C, se registró en enero de 1942, mientras que el récord de calor, 44,2 °C, se registró en julio de 2007.
La temperatura media del mes más frío (enero) es de 1,4 °C, la del mes más cálido (agosto) es de 22,8 °C. Aquí están las temperaturas medias.

Las precipitaciones ascienden a 580 mm por año: son por lo tanto a un nivel intermedio. En el mes menos lluvioso (febrero) caen 35 mm de lluvia (o nieve), en el más lluvioso (mayo) caen 60 mm. Aquí están las precipitaciones promedio.

En promedio, hay aproximadamente 2.000 horas de sol al año. El sol no se ve a menudo en invierno, mientras que en verano brilla durante un buen número de horas. Aquí está el promedio de horas de sol al día.

Cuándo ir

Los mejores períodos para visitar Niš son las estaciones intermedias, y en particular los meses de mayo y septiembre. En junio, el clima suele ser excelente, pero a veces puede hacer mucho calor, especialmente en la segunda mitad del mes.